药店的健康证办理程序如下：
准备材料
本人身份证
个人免冠一寸彩色照片两张
选择体检地点
当地疾病预防控制中心
经卫生行政部门审批承担预防性健康检查的医疗卫生机构
体检流程
携带上述材料到体检地点，领取体检表并进行缴费
进行各项体检，包括采血、肛检、内科常规体检、外科常规体检、X光胸透等
卫生知识培训
体检合格后，参加由卫生监督机构组织的卫生法律法规知识培训
领取健康证
培训合格后，携带本人正面免冠彩色照片到所管辖的卫生局卫生监督所办理健康证明
建议提前咨询当地的卫生健康部门或相关机构，了解具体的办理流程和所需材料，以确保顺利办理健康证。