CMOS设置程序保存在 BIOS芯片中。BIOS（Basic Input-Output System，基本输入输出系统）是一组固化到主板ROM芯片中的程序，它包含了系统启动时需要的基本输入输出功能、硬件配置信息以及用户设置的参数等。CMOS（Complementary Metal-Oxide-Semiconductor，互补金属氧化物半导体）RAM则是一块位于主板上的可擦写RAM芯片，用于在系统断电后仍然保存这些设置信息，并由主板上的电池供电以保持数据不丢失。
因此，无论是早期的软盘还是现代的BIOS芯片，CMOS设置程序最终都是存储在主板上的ROM芯片中，以便在开机时可以通过特定按键进入并进行系统设置。