协议程序要求通常包括以下几个方面：
当事人意思表示真实：
协议当事人应当基于真实意愿达成协议，不存在欺诈、胁迫等情况。
内容、形式和订立程序合法：
协议的内容、形式和订立过程必须符合国家法律、行政法规的要求，不违反强制性规定。
依法订立：
双方当事人订立合同必须遵循法律、行政法规的规定，确保合同的有效性。
协商一致：
合同必须是经过双方当事人充分协商并达成一致意见，不存在分歧。
要约和承诺阶段：
合同的成立应具备要约和承诺两个阶段，即一方发出要约，另一方做出承诺，且承诺生效后合同即告成立。
使用机构模板：
某些情况下，协议需要采用特定机构提供的模板，并且可能需要通过机构的审核。
签字和盖章：
合同或协议在定稿后，需要相关责任人签字并加盖公章或合同专用章，以证明其有效性。
提供必要文件：
在签订协议时，可能需要提供一系列相关文件，如身份证明、授权委托书、立项资料等。
符合伦理和审批要求：
特别是涉及医疗、科研等领域的协议，还需要符合相关的伦理和审批程序，例如伦理批件时间和预计启动时间的告知。
填写完整信息：
协议中的各项内容，如合同总金额、项目负责人、经办科室等，需要填写完整，并由相关负责人签字确认。
这些要求确保了协议的法律效力，保护了各方的合法权益，并有助于防止因程序不当而产生的法律纠纷。在实际操作中，建议各方当事人仔细阅读并遵守相关程序，以确保协议的顺利签订和履行。