深水井施工程序通常包括以下几个步骤：
井孔结构设计 ：根据水井的出水量要求，设计井深和井径，选择合适的钻探机型及辅助设备。准备工作：
在钻孔之前，进行机台调平、设备布置、器材堆存、塔架竖立和钻机安放等工作。
钻探成孔
在松散地层中，通常采用冲击式钻机清水水压逐级扩孔法施工工艺。
在基岩含水层中，通常采用回转式岩心钻进，并在钻进过程中进行地下水水位和循环液孔内消失量等水文地质观测。
取样与观测：
在钻探成孔过程中，根据技术要求进行描述、分层取土样、取水样、测温等，确保取样质量和数量。
成井工艺
下井管前，对钻孔孔壁、孔径、孔深进行校核，确保孔壁规则圆滑，必要时进行修整，并实测孔深。
换浆：用稀浆或清水将原成孔时的浓浆替换出孔，直至井内返上泥浆与压入的稀浆水浓度基本相同。
下管：按技术要求安装井管找中器，进行焊工作业，并加焊拉板，管内必要时加浮板，管底用钢板焊封。
填砾料：将选好的砾料投入井管过滤器及孔壁之间的环状空间内，根据地质技术要求和地层情况选用适当的投砾法。
止水：常用粘土球止水法，确保粘土球质量，分层填入并逐层填满，填实。
洗井：彻底清除钻井过程中孔内岩屑等对含水层的封堵，抽出滤水管周围含水层中的泥浆、粉、细砂等沉淀，保证含水层出水通畅。
安装与调试
安装深水泵并连接水管，安装水泵自动控制箱，并进行调试至正常。
在井管内下设水泵，安装抽水控制电路，并进行试抽水，确保降水井正常工作。
收尾工作
降水完毕后，拔出井管并进行封井。
这些步骤确保了深水井施工的质量和安全性，同时达到了设计的水文地质要求。建议在实际操作中，根据具体地层情况和施工条件，灵活调整施工工艺和参数，以确保施工顺利进行和最终成果的质量。