杂交育种的一般程序包括以下步骤：
选择亲本
选择亲本需根据育种目标和目的，从当地挑选最适合条件的品种。
去雄
对于双性生殖或自花授粉植物，在花药柱头具有接受性和花药开裂之前去除雄蕊，以避免自花授粉。
套袋
去雄后的雌花或花序要立即套袋，防止外来花粉授粉，确保杂交的纯度。
授粉或授精
进行亲本自交或人工授精，使用纯合子以消除不良性状并获得自交系。
收获储存F1种子
收获杂交后的果荚或穗子，在完全干燥后进行脱粒，储存F1种子。
初筛与复筛
对杂交后代进行初步筛选，然后进行复筛，确保选出理想的新品系。
试验与示范
在试验田进行杂交后代的试验，并示范推广新品种。
此外，根据不同的育种需求和实际情况，杂交育种程序可能会有所调整。例如，在创新阶段，可能会采用多个品种进行杂交，以扩大遗传多样性；在定型阶段，则可能通过横交和近交相结合的方法，固定理想的性状，提高群体的纯度和整齐度。
建议在实际操作中，根据具体的育种目标和条件，灵活调整杂交程序，以确保杂交育种的成功和高效。