修改竣工图需要遵循以下程序：
变更申请
施工单位根据实际施工情况，向设计单位提出变更申请，并提供详细的变更内容和理由。
设计单位审核
设计单位对变更申请进行审核，评估变更的合理性和可行性，并给出审批意见。
建设单位确认
建设单位根据设计单位的审批意见，确认是否需要进行变更。如果确认需要变更，建设单位会要求原勘察设计企业进行修改。
修改施工图
原勘察设计企业根据建设单位的要求，对施工图进行修改，并出具修改后的施工图。
审查机构复审
建设单位将修改后的施工图送原审查机构进行复审。审查机构对修改后的施工图进行审核，确保其符合相关规范和标准。
编制竣工图
根据审查合格的修改后的施工图，施工单位或监理单位编制竣工图。在编制过程中，需要注明修改依据，如设计变更单、图纸会审或材料代用单的编号。
竣工图审核
监理单位督促和协助竣工图编制单位检查竣工图编制情况，发现不准确或短缺时及时修改和补齐。设计单位和审查机构对竣工图进行审核，确保所有应修改的地方已经修改，图与图相关联的地方已做相应的修改，所有修改处都标注了修改依据，修改的依据签章齐全。
盖章签字
审核合格的竣工图需要加盖竣工图章，并由相关人员签字确认。
提交建委审批
建设单位将审核合格的竣工图提交给建委进行审批。建委对竣工图进行最终审核，确保其符合相关要求和标准。
通过以上审批流程，可以确保竣工图的准确性和完整性，为工程的竣工验收和后续使用提供可靠的依据。