农民讨薪应遵循以下程序：
与用人单位协商
首先尝试与用人单位进行协商，要求其支付拖欠的工资。在协商过程中，可以联合起来选出代表，并主动出示相关证据如劳动合同、考勤记录等，同时注意通过录音等方式保存协商记录，并明确告知对方政府及法律对拖欠工资的处罚规定。
投诉至劳动监察部门
如果协商无果，可以向劳动监察部门投诉。劳动监察部门负责监督检查用人单位遵守劳动保障法律、法规和规章的情况，并有权责令用人单位限期支付工资。对逾期不支付的，可责令用人单位按应付金额百分之五十以上百分之一百以下的标准向农民工加付赔偿金。
申请劳动争议仲裁
劳动者可以向劳动争议仲裁委员会提起仲裁申请，要求用人单位支付工资。劳动争议适用仲裁前置，劳动者不能直接提起诉讼。
提起诉讼
如果对仲裁裁决不服，劳动者可以向法院提起诉讼，要求支付相应工资。在提起诉讼前，农民工应当搜集所有能证明劳动关系和工资被克扣的证据，包括但不限于劳动合同、用工协议、考勤卡、工资卡、上岗证、欠条以及完成任务的记录等。
申请支付令
如果有欠条，劳动者可以直接向法院申请支付令，要求用人单位支付欠条里的工资数额。
利用第三方调解
可以向劳动争议调解委员会申请调解，争取以和解的方式解决纠纷。劳动争议调解委员会由职工代表、用人单位代表和工会代表组成，调解委员会主任必须由工会代表担任。
申请法律援助
农民工可向负有支付劳动报酬义务的欠款人住所地的法律援助机构提出法律援助申请，以获得法律帮助。
建议农民工在讨薪过程中，先尝试通过协商和调解解决问题，如果这些方法都无法奏效，再考虑通过法律途径来维护自己的权益。在整个过程中，保留好所有相关证据，以便在需要时能够提供有力的支持。